BCKDHB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1DTW, 1OLS, 1OLU, 1OLX, 1U5B, 1V11, 1V16, 1V1M, 1V1R, 1WCI, 1X7W, 1X7X, 1X7Y, 1X7Z, 1X80, 2BEU, 2BEV, 2BEW, 2BFB, 2BFC, 2BFD, 2BFE, 2BFF, 2J9F

Ідентифікатори

Символи

BCKDHB, E1B, dJ279A18.1, BCKDE1B, BCKDH E1-beta, branched chain keto acid dehydrogenase E1, beta polypeptide, branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta

Зовнішні ІД

OMIM: 248611 MGI: 88137 HomoloGene: 39 GeneCards: BCKDHB

Пов'язані генетичні захворювання

maple syrup urine disease type 1B^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• oxidoreductase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (2-methylpropanoyl-transferring) activity • каталітична активність
Клітинна компонента	• мітохондріальний матрикс • mitochondrial alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex • мітохондрія
Біологічний процес	• обмін речовин • branched-chain amino acid catabolic process • response to nutrient
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


594


12040

Ensembl


ENSG00000083123


ENSMUSG00000032263

UniProt


P21953


Q6P3A8

RefSeq (мРНК)


NM_000056 NM_183050 NM_001318975


NM_199195 NM_001305935

RefSeq (білок)


NP_000047 NP_001305904 NP_898871


NP_001292864 NP_954665

Локус (UCSC)

Хр. 6: 80.11 – 80.35 Mb

Хр. 9: 83.81 – 84.01 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BCKDHB (англ. Branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 392 амінокислот, а молекулярна маса — 43 122^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVVAAAAGW	LLRLRAAGAE	GHWRRLPGAG	LARGFLHPAA	TVEDAAQRRQ
VAHFTFQPDP	EPREYGQTQK	MNLFQSVTSA	LDNSLAKDPT	AVIFGEDVAF
GGVFRCTVGL	RDKYGKDRVF	NTPLCEQGIV	GFGIGIAVTG	ATAIAEIQFA
DYIFPAFDQI	VNEAAKYRYR	SGDLFNCGSL	TIRSPWGCVG	HGALYHSQSP
EAFFAHCPGI	KVVIPRSPFQ	AKGLLLSCIE	DKNPCIFFEP	KILYRAAAEE
VPIEPYNIPL	SQAEVIQEGS	DVTLVAWGTQ	VHVIREVASM	AKEKLGVSCE
VIDLRTIIPW	DVDTICKSVI	KTGRLLISHE	APLTGGFASE	ISSTVQEECF
LNLEAPISRV	CGYDTPFPHI	FEPFYIPDKW	KCYDALRKMI	NY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chuang J.L., Cox R.P., Chuang D.T. (1990). Molecular cloning of the mature E1b-beta subunit of human branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex. FEBS Lett. 262: 305—309. PMID 2335211 DOI:10.1016/0014-5793(90)80215-5
Wynn R.M., Kochi H., Cox R.P., Chuang D.T. (1994). Differential processing of human and rat E1 alpha precursors of the branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex caused by an N-terminal proline in the rat sequence. Biochim. Biophys. Acta. 1201: 125—128. PMID 7918575 DOI:10.1016/0304-4165(94)90161-9
Wang Y.P., Qi M.L., Li T.T., Zhao Y.J. (2012). Two novel mutations in the BCKDHB gene (R170H, Q346R) cause the classic form of maple syrup urine disease (MSUD). Gene. 498: 112—115. PMID 22326532 DOI:10.1016/j.gene.2012.01.082
Chuang J.L., Cox R.P., Chuang D.T. (1996). Maple syrup urine disease: the E1beta gene of human branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase complex has 11 rather than 10 exons, and the 3' UTR in one of the two E1beta mRNAs arises from intronic sequences. Am. J. Hum. Genet. 58: 1373—1377. PMID 8651316

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з BCKDHB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:987 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P21953 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.