CXCL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1MGS, 1MSG, 1MSH

Ідентифікатори

Символи

CXCL1, FSP, GRO1, GROa, MGSA, MGSA-a, NAP-3, SCYB1, C-X-C motif chemokine ligand 1

Зовнішні ІД

OMIM: 155730 MGI: 3037818 HomoloGene: 136748 GeneCards: CXCL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding • growth factor activity • cytokine activity • GO:0010577 enzyme activator activity • CXCR chemokine receptor binding • chemokine activity
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір • specific granule lumen • tertiary granule lumen
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation • GO:0007243 intracellular signal transduction • response to lipopolysaccharide • GO:0072468 сигнальна трансдукція • G protein-coupled receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • positive regulation of neutrophil chemotaxis • проліферація • actin cytoskeleton organization • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • chemokine-mediated signaling pathway • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • cell chemotaxis • хемотаксис • defense response • inflammatory response • neutrophil degranulation • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • cytokine-mediated signaling pathway • neutrophil chemotaxis • leukocyte chemotaxis • cellular response to lipopolysaccharide
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2919


330122

Ensembl


ENSG00000163739


ENSMUSG00000029379

UniProt


P09341


Q6W5C0

RefSeq (мРНК)


NM_001511


NM_203320

RefSeq (білок)


NP_001502


NP_976065

Локус (UCSC)

Хр. 4: 73.87 – 73.87 Mb

Хр. 5: 90.93 – 90.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CXCL1 (англ. C-X-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 107 амінокислот, а молекулярна маса — 11 301^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARAALSAAP	SNPRLLRVAL	LLLLLVAAGR	RAAGASVATE	LRCQCLQTLQ
GIHPKNIQSV	NVKSPGPHCA	QTEVIATLKN	GRKACLNPAS	PIVKKIIEKM
LNSDKSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, факторів росту. Задіяний у такому біологічному процесі як запальна відповідь. Секретований назовні.

Література

Anisowicz A., Bardwell L., Sager R. (1987). Constitutive overexpression of a growth-regulated gene in transformed Chinese hamster and human cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 7188—7192. PMID 2890161 DOI:10.1073/pnas.84.20.7188
Baker N.E., Kucera G., Richmond A. (1990). Nucleotide sequence of the human melanoma growth stimulatory activity (MGSA) gene. Nucleic Acids Res. 18: 6453—6453. PMID 2129556 DOI:10.1093/nar/18.21.6453
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Schroeder J.-M., Persoon N.L.M., Christophers E. (1990). Lipopolysaccharide-stimulated human monocytes secrete, apart from neutrophil-activating peptide 1/interleukin 8, a second neutrophil-activating protein. NH2-terminal amino acid sequence identity with melanoma growth stimulatory activity. J. Exp. Med. 171: 1091—1100. PMID 2182761 DOI:10.1084/jem.171.4.1091
Golds E.E., Mason P., Nyirkos P. (1989). Inflammatory cytokines induce synthesis and secretion of gro protein and a neutrophil chemotactic factor but not beta 2-microglobulin in human synovial cells and fibroblasts. Biochem. J. 259: 585—588. PMID 2655583 DOI:10.1042/bj2590585
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4602 (англ.) . Архів оригіналу за 2 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P09341 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.