LAMA3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | LAMA3, BM600, E170, LAMNA, LOCS, lama3a, Laminin, alpha 3, laminin subunit alpha 3, JEB2B, JEB2A, JEB2C |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600805 MGI: 99909 HomoloGene: 18279 GeneCards: LAMA3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
бічний аміотрофічний склероз, Laryngoonychocutaneous syndrome, junctional epidermolysis bullosa Herlitz type[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • signaling receptor binding • structural molecule activity • extracellular matrix structural constituent • integrin binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • базальна мембрана • laminin-5 complex • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • ендоплазматичний ретикулум • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • hemidesmosome assembly • адгезія клітин • extracellular matrix disassembly • regulation of cell adhesion • extracellular matrix organization • regulation of cell migration • endodermal cell differentiation • regulation of embryonic development • epidermis development • morphogenesis of a polarized epithelium • integrin-mediated signaling pathway • animal organ morphogenesis • гістогенез • cell migration • cell-cell adhesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b7/PBB_GE_LAMA3_gnf1h02350_at_fs.png/250px-PBB_GE_LAMA3_gnf1h02350_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c5/PBB_GE_LAMA3_203726_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LAMA3_203726_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d1/PBB_GE_LAMA3_gnf1h02351_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LAMA3_gnf1h02351_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_000227 NM_001127717 NM_001127718 NM_001302996 NM_198129 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_000218 NP_001121189 NP_001121190 NP_001289925 NP_937762 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 23.69 – 23.96 Mb | Хр. 18: 12.47 – 12.72 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMA3 (англ. Laminin subunit alpha 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 333 амінокислот, а молекулярна маса — 366 649[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAAARPRGR | | ALGPVLPPTP | | LLLLVLRVLP | | ACGATARDPG | | AAAGLSLHPT |
YFNLAEAARI | | WATATCGERG | | PGEGRPQPEL | | YCKLVGGPTA | | PGSGHTIQGQ |
FCDYCNSEDP | | RKAHPVTNAI | | DGSERWWQSP | | PLSSGTQYNR | | VNLTLDLGQL |
FHVAYILIKF | | ANSPRPDLWV | | LERSVDFGST | | YSPWQYFAHS | | KVDCLKEFGR |
EANMAVTRDD | | DVLCVTEYSR | | IVPLENGEVV | | VSLINGRPGA | | KNFTFSHTLR |
EFTKATNIRL | | RFLRTNTLLG | | HLISKAQRDP | | TVTRRYYYSI | | KDISIGGQCV |
CNGHAEVCNI | | NNPEKLFRCE | | CQHHTCGETC | | DRCCTGYNQR | | RWRPAAWEQS |
HECEACNCHG | | HASNCYYDPD | | VERQQASLNT | | QGIYAGGGVC | | INCQHNTAGV |
NCEQCAKGYY | | RPYGVPVDAP | | DGCIPCSCDP | | EHADGCEQGS | | GRCHCKPNFH |
GDNCEKCAIG | | YYNFPFCLRI | | PIFPVSTPSS | | EDPVAGDIKG | | CDCNLEGVLP |
EICDAHGRCL | | CRPGVEGPRC | | DTCRSGFYSF | | PICQACWCSA | | LGSYQMPCSS |
VTGQCECRPG | | VTGQRCDRCL | | SGAYDFPHCQ | | GSSSACDPAG | | TINSNLGYCQ |
CKLHVEGPTC | | SRCKLLYWNL | | DKENPSGCSE | | CKCHKAGTVS | | GTGECRQGDG |
DCHCKSHVGG | | DSCDTCEDGY | | FALEKSNYFG | | CQGCQCDIGG | | ALSSMCSGPS |
GVCQCREHVV | | GKVCQRPENN | | YYFPDLHHMK | | YEIEDGSTPN | | GRDLRFGFDP |
LAFPEFSWRG | | YAQMTSVQND | | VRITLNVGKS | | SGSLFRVILR | | YVNPGTEAVS |
GHITIYPSWG | | AAQSKEIIFL | | PSKEPAFVTV | | PGNGFADPFS | | ITPGIWVACI |
KAEGVLLDYL | | VLLPRDYYEA | | SVLQLPVTEP | | CAYAGPPQEN | | CLLYQHLPVT |
RFPCTLACEA | | RHFLLDGEPR | | PVAVRQPTPA | | HPVMVDLSGR | | EVELHLRLRI |
PQVGHYVVVV | | EYSTEAAQLF | | VVDVNVKSSG | | SVLAGQVNIY | | SCNYSVLCRS |
AVIDHMSRIA | | MYELLADADI | | QLKGHMARFL | | LHQVCIIPIE | | EFSAEYVRPQ |
VHCIASYGRF | | VNQSATCVSL | | AHETPPTALI | | LDVLSGRPFP | | HLPQQSSPSV |
DVLPGVTLKA | | PQNQVTLRGR | | VPHLGRYVFV | | IHFYQAAHPT | | FPAQVSVDGG |
WPRAGSFHAS | | FCPHVLGCRD | | QVIAEGQIEF | | DISEPEVAAT | | VKVPEGKSLV |
LVRVLVVPAE | | NYDYQILHKK | | SMDKSLEFIT | | NCGKNSFYLD | | PQTASRFCKN |
SARSLVAFYH | | KGALPCECHP | | TGATGPHCSP | | EGGQCPCQPN | | VIGRQCTRCA |
TGHYGFPRCK | | PCSCGRRLCE | | EMTGQCRCPP | | RTVRPQCEVC | | ETHSFSFHPM |
AGCEGCNCSR | | RGTIEAAMPE | | CDRDSGQCRC | | KPRITGRQCD | | RCASGFYRFP |
ECVPCNCNRD | | GTEPGVCDPG | | TGACLCKENV | | EGTECNVCRE | | GSFHLDPANL |
KGCTSCFCFG | | VNNQCHSSHK | | RRTKFVDMLG | | WHLETADRVD | | IPVSFNPGSN |
SMVADLQELP | | ATIHSASWVA | | PTSYLGDKVS | | SYGGYLTYQA | | KSFGLPGDMV |
LLEKKPDVQL | | TGQHMSIIYE | | ETNTPRPDRL | | HHGRVHVVEG | | NFRHASSRAP |
VSREELMTVL | | SRLADVRIQG | | LYFTETQRLT | | LSEVGLEEAS | | DTGSGRIALA |
VEICACPPAY | | AGDSCQGCSP | | GYYRDHKGLY | | TGRCVPCNCN | | GHSNQCQDGS |
GICVNCQHNT | | AGEHCERCQE | | GYYGNAVHGS | | CRACPCPHTN | | SFATGCVVNG |
GDVRCSCKAG | | YTGTQCERCA | | PGYFGNPQKF | | GGSCQPCSCN | | SNGQLGSCHP |
LTGDCINQEP | | KDSSPAEECD | | DCDSCVMTLL | | NDLATMGEQL | | RLVKSQLQGL |
SASAGLLEQM | | RHMETQAKDL | | RNQLLNYRSA | | ISNHGSKIEG | | LERELTDLNQ |
EFETLQEKAQ | | VNSRKAQTLN | | NNVNRATQSA | | KELDVKIKNV | | IRNVHILLKQ |
ISGTDGEGNN | | VPSGDFSREW | | AEAQRMMREL | | RNRNFGKHLR | | EAEADKRESQ |
LLLNRIRTWQ | | KTHQGENNGL | | ANSIRDSLNE | | YEAKLSDLRA | | RLQEAAAQAK |
QANGLNQENE | | RALGAIQRQV | | KEINSLQSDF | | TKYLTTADSS | | LLQTNIALQL |
MEKSQKEYEK | | LAASLNEARQ | | ELSDKVRELS | | RSAGKTSLVE | | EAEKHARSLQ |
ELAKQLEEIK | | RNASGDELVR | | CAVDAATAYE | | NILNAIKAAE | | DAANRAASAS |
ESALQTVIKE | | DLPRKAKTLS | | SNSDKLLNEA | | KMTQKKLKQE | | VSPALNNLQQ |
TLNIVTVQKE | | VIDTNLTTLR | | DGLHGIQRGD | | IDAMISSAKS | | MVRKANDITD |
EVLDGLNPIQ | | TDVERIKDTY | | GRTQNEDFKK | | ALTDADNSVN | | KLTNKLPDLW |
RKIESINQQL | | LPLGNISDNM | | DRIRELIQQA | | RDAASKVAVP | | MRFNGKSGVE |
VRLPNDLEDL | | KGYTSLSLFL | | QRPNSRENGG | | TENMFVMYLG | | NKDASRDYIG |
MAVVDGQLTC | | VYNLGDREAE | | LQVDQILTKS | | ETKEAVMDRV | | KFQRIYQFAR |
LNYTKGATSS | | KPETPGVYDM | | DGRNSNTLLN | | LDPENVVFYV | | GGYPPDFKLP |
SRLSFPPYKG | | CIELDDLNEN | | VLSLYNFKKT | | FNLNTTEVEP | | CRRRKEESDK |
NYFEGTGYAR | | VPTQPHAPIP | | TFGQTIQTTV | | DRGLLFFAEN | | GDRFISLNIE |
DGKLMVRYKL | | NSELPKERGV | | GDAINNGRDH | | SIQIKIGKLQ | | KRMWINVDVQ |
NTIIDGEVFD | | FSTYYLGGIP | | IAIRERFNIS | | TPAFRGCMKN | | LKKTSGVVRL |
NDTVGVTKKC | | SEDWKLVRSA | | SFSRGGQLSF | | TDLGLPPTDH | | LQASFGFQTF |
QPSGILLDHQ | | TWTRNLQVTL | | EDGYIELSTS | | DSGSPIFKSP | | QTYMDGLLHY |
VSVISDNSGL | | RLLIDDQLLR | | NSKRLKHISS | | SRQSLRLGGS | | NFEGCISNVF |
VQRLSLSPEV | | LDLTSNSLKR | | DVSLGGCSLN | | KPPFLMLLKG | | STRFNKTKTF |
RINQLLQDTP | | VASPRSVKVW | | QDACSPLPKT | | QANHGALQFG | | DIPTSHLLFK |
LPQELLKPRS | | QFAVDMQTTS | | SRGLVFHTGT | | KNSFMALYLS | | KGRLVFALGT |
DGKKLRIKSK | | EKCNDGKWHT | | VVFGHDGEKG | | RLVVDGLRAR | | EGSLPGNSTI |
SIRAPVYLGS | | PPSGKPKSLP | | TNSFVGCLKN | | FQLDSKPLYT | | PSSSFGVSSC |
LGGPLEKGIY | | FSEEGGHVVL | | AHSVLLGPEF | | KLVFSIRPRS | | LTGILIHIGS |
QPGKHLCVYL | | EAGKVTASMD | | SGAGGTSTSV | | TPKQSLCDGQ | | WHSVAVTIKQ |
HILHLELDTD | | SSYTAGQIPF | | PPASTQEPLH | | LGGAPANLTT | | LRIPVWKSFF |
GCLRNIHVNH | | IPVPVTEALE | | VQGPVSLNGC | | PDQ |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Ryan M.C., Tizard R., Vandevanter D.R., Carter W.G. (1994). Cloning of the LamA3 gene encoding the alpha 3 chain of the adhesive ligand epiligrin. Expression in wound repair. J. Biol. Chem. 269: 22779—22787. PMID 8077230
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMA3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6483 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q16787 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |