SNX9 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/90/Protein_SNX9_PDB_2RAI.png/250px-Protein_SNX9_PDB_2RAI.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2RAI, 2RAJ, 2RAK, 3DYT, 3DYU, 3LGE | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNX9, SDP1, SH3PX1, SH3PXD3A, WISP, sorting nexin 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605952 MGI: 1913866 HomoloGene: 49454 GeneCards: SNX9 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • Arp2/3 complex binding • 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • ubiquitin protein ligase binding • lipid binding • cadherin binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • ruffle • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • trans-Golgi network • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • clathrin-coated vesicle • гіалоплазма • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • cuticular plate |
---|
Біологічний процес | • ендоцитоз • cleavage furrow formation • mitotic cytokinesis • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • рецептор-опосередкований ендоцитоз • plasma membrane tubulation • поділ клітини • endosomal transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of protein oligomerization • protein transport • lipid tube assembly • клітинний цикл • intracellular protein transport • positive regulation of protein kinase activity • membrane organization • GO:0007067 мітоз • GO:0015915 транспорт • positive regulation of actin filament polymerization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/49/PBB_GE_SNX9_gnf1h00218_at_fs.png/250px-PBB_GE_SNX9_gnf1h00218_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 157.7 – 157.95 Mb | Хр. 17: 5.89 – 5.98 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNX9 (англ. Sorting nexin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 66 592[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MATKARVMYD | | FAAEPGNNEL | | TVNEGEIITI | | TNPDVGGGWL | | EGRNIKGERG |
LVPTDYVEIL | | PSDGKDQFSC | | GNSVADQAFL | | DSLSASTAQA | | SSSAASNNHQ |
VGSGNDPWSA | | WSASKSGNWE | | SSEGWGAQPE | | GAGAQRNTNT | | PNNWDTAFGH |
PQAYQGPATG | | DDDDWDEDWD | | GPKSSSYFKD | | SESADAGGAQ | | RGNSRASSSS |
MKIPLNKFPG | | FAKPGTEQYL | | LAKQLAKPKE | | KIPIIVGDYG | | PMWVYPTSTF |
DCVVADPRKG | | SKMYGLKSYI | | EYQLTPTNTN | | RSVNHRYKHF | | DWLYERLLVK |
FGSAIPIPSL | | PDKQVTGRFE | | EEFIKMRMER | | LQAWMTRMCR | | HPVISESEVF |
QQFLNFRDEK | | EWKTGKRKAE | | RDELAGVMIF | | STMEPEAPDL | | DLVEIEQKCE |
AVGKFTKAMD | | DGVKELLTVG | | QEHWKRCTGP | | LPKEYQKIGK | | ALQSLATVFS |
SSGYQGETDL | | NDAITEAGKT | | YEEIASLVAE | | QPKKDLHFLM | | ECNHEYKGFL |
GCFPDIIGTH | | KGAIEKVKES | | DKLVATSKIT | | LQDKQNMVKR | | VSIMSYALQA |
EMNHFHSNRI | | YDYNSVIRLY | | LEQQVQFYET | | IAEKLRQALS | | RFPVM |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ендоцитоз, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
- Howard L., Nelson K.K., Maciewicz R.A., Blobel C.P. (1999). Interaction of the metalloprotease disintegrins MDC9 and MDC15 with two SH3 domain-containing proteins, endophilin I and SH3PX1. J. Biol. Chem. 274: 31693—31699. PMID 10531379 DOI:10.1074/jbc.274.44.31693
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lin Q., Lo C.G., Cerione R.A., Yang W. (2002). The Cdc42 target ACK2 interacts with sorting nexin 9 (SH3PX1) to regulate epidermal growth factor receptor degradation. J. Biol. Chem. 277: 10134—10138. PMID 11799118 DOI:10.1074/jbc.M110329200
- Lundmark R., Carlsson S.R. (2003). Sorting nexin 9 participates in clathrin-mediated endocytosis through interactions with the core components. J. Biol. Chem. 278: 46772—46781. PMID 12952949 DOI:10.1074/jbc.M307334200
- Yeow-Fong L., Lim L., Manser E. (2005). SNX9 as an adaptor for linking synaptojanin-1 to the Cdc42 effector ACK1. FEBS Lett. 579: 5040—5048. PMID 16137687 DOI:10.1016/j.febslet.2005.07.093
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14973 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5X1 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |