TDRD7

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3RCO

Ідентифікатори

Символи

TDRD7, CATC4, CTRCT36, PCTAIRE2BP, TRAP, tudor domain containing 7

Зовнішні ІД

OMIM: 611258 MGI: 2140279 HomoloGene: 8618 GeneCards: TDRD7

Пов'язані генетичні захворювання

cataract 36^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• mRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein N-terminus binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • chromatoid body • мітохондріальний матрикс • ribonucleoprotein granule
Біологічний процес	• posttranscriptional regulation of gene expression • диференціація клітин • lens fiber cell differentiation • lens morphogenesis in camera-type eye • Сперматогенез
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23424


100121

Ensembl


ENSG00000196116


ENSMUSG00000035517

UniProt


Q8NHU6


Q8K1H1

RefSeq (мРНК)


NM_001302884 NM_014290


NM_001290475 NM_146142 NM_001355189

RefSeq (білок)


NP_001289813 NP_055105


NP_001277404 NP_666254 NP_001342118

Локус (UCSC)

Хр. 9: 97.41 – 97.5 Mb

Хр. 4: 45.97 – 46.03 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TDRD7 (англ. Tudor domain containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 098 амінокислот, а молекулярна маса — 123 586^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLEGDLVSKM	LRAVLQSHKN	GVALPRLQGE	YRSLTGDWIP	FKQLGFPTLE
AYLRSVPAVV	RIETSRSGEI	TCYAMACTET	ARIAQLVARQ	RSSKRKTGRQ
VNCQMRVKKT	MPFFLEGKPK	ATLRQPGFAS	NFSVGKKPNP	APLRDKGNSV
GVKPDAEMSP	YMLHTTLGNE	AFKDIPVQRH	VTMSTNNRFS	PKASLQPPLQ
MHLSRTSTKE	MSDNLNQTVE	KPNVKPPASY	TYKMDEVQNR	IKEILNKHNN
GIWISKLPHF	YKELYKEDLN	QGILQQFEHW	PHICTVEKPC	SGGQDLLLYP
AKRKQLLRSE	LDTEKVPLSP	LPGPKQTPPL	KGCPTVMAGD	FKEKVADLLV
KYTSGLWASA	LPKAFEEMYK	VKFPEDALKN	LASLSDVCSI	DYISGNPQKA
ILYAKLPLPT	DKIQKDAGQA	HGDNDIKAMV	EQEYLQVEES	IAESANTFME
DITVPPLMIP	TEASPSVLVV	ELSNTNEVVI	RYVGKDYSAA	QELMEDEMKE
YYSKNPKITP	VQAVNVGQLL	AVNAEEDAWL	RAQVISTEEN	KIKVCYVDYG
FSENVEKSKA	YKLNPKFCSL	SFQATKCKLA	GLEVLSDDPD	LVKVVESLTC
GKIFAVEILD	KADIPLVVLY	DTSGEDDINI	NATCLKAICD	KSLEVHLQVD
AMYTNVKVTN	ICSDGTLYCQ	VPCKGLNKLS	DLLRKIEDYF	HCKHMTSECF
VSLPFCGKIC	LFHCKGKWLR	VEITNVHSSR	ALDVQFLDSG	TVTSVKVSEL
REIPPRFLQE	MIAIPPQAIK	CCLADLPQSI	GMWTPDAVLW	LRDSVLNCSD
CSIKVTKVDE	TRGIAHVYLF	TPKNFPDPHR	SINRQITNAD	LWKHQKDVFL
SAISSGADSP	NSKNGNMPMS	GNTGENFRKN	LTDVIKKSMV	DHTSAFSTEE
LPPPVHLSKP	GEHMDVYVPV	ACHPGYFVIQ	PWQEIHKLEV	LMEEMILYYS
VSEERHIAVE	KDQVYAAKVE	NKWHRVLLKG	ILTNGLVSVY	ELDYGKHELV
NIRKVQPLVD	MFRKLPFQAV	TAQLAGVKCN	QWSEEASMVF	RNHVEKKPLV
ALVQTVIENA	NPWDRKVVVY	LVDTSLPDTD	TWIHDFMSEY	LIELSKVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Callebaut I., Mornon J.P. (2010). LOTUS, a new domain associated with small RNA pathways in the germline. Bioinformatics. 26: 1140—1144. PMID 20305267 DOI:10.1093/bioinformatics/btq122
Anantharaman V., Zhang D., Aravind L. (2010). OST-HTH: a novel predicted RNA-binding domain. Biol. Direct. 5: 13—13. PMID 20302647 DOI:10.1186/1745-6150-5-13

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TDRD7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30831 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8NHU6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.