UTP15

Ідентифікатори

Символи

UTP15, NET21, small subunit processome component, UTP15 small subunit processome component

Зовнішні ІД

OMIM: 616194 MGI: 2145443 HomoloGene: 6629 GeneCards: UTP15

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • fibrillar center • ядерце • нуклеоплазма • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• rRNA processing • positive regulation of transcription by RNA polymerase I • positive regulation of rRNA processing • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ribosome biogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84135


105372

Ensembl


ENSG00000164338


ENSMUSG00000041747

UniProt


Q8TED0


Q8C7V3

RefSeq (мРНК)


NM_001284430 NM_001284431 NM_032175


NM_178918

RefSeq (білок)


NP_001271359 NP_001271360 NP_115551


NP_849249

Локус (UCSC)

Хр. 5: 73.57 – 73.58 Mb

Хр. 13: 98.38 – 98.4 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UTP15 (англ. UTP15, small subunit processome component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 58 415^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGYKPVAIQ	TYPILGEKIT	QDTLYWNNYK	TPVQIKEFGA	VSKVDFSPQP
PYNYAVTASS	RIHIYGRYSQ	EPIKTFSRFK	DTAYCATFRQ	DGRLLVAGSE
DGGVQLFDIS	GRAPLRQFEG	HTKAVHTVDF	TADKYHVVSG	ADDYTVKLWD
IPNSKEILTF	KEHSDYVRCG	CASKLNPDLF	ITGSYDHTVK	MFDARTSESV
LSVEHGQPVE	SVLLFPSGGL	LVSAGGRYVK	VWDMLKGGQL	LVSLKNHHKT
VTCLCLSSSG	QRLLSGSLDR	KVKVYSTTSY	KVVHSFDYAA	SILSLALAHE
DETIVVGMTN	GILSVKHRKS	EAKKESLPRR	RRPAYRTFIK	GKNYMKQRDD
ILINRPAKKH	LELYDRDLKH	FRISKALDRV	LDPTCTIKTP	EITVSIIKEL
NRRGVLANAL	AGRDEKEISH	VLNFLIRNLS	QPRFAPVLIN	AAEIIIDIYL
PVIGQSPVVD	KKFLLLQGLV	EKEIDYQREL	LETLGMMDML	FATMRRKEGT
SVLEHTSDGF	PENKKIES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, процесінг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Prieto J.L., McStay B. (2007). Recruitment of factors linking transcription and processing of pre-rRNA to NOR chromatin is UBF-dependent and occurs independent of transcription in human cells. Genes Dev. 21: 2041—2054. PMID 17699751 DOI:10.1101/gad.436707
Freed E.F., Prieto J.L., McCann K.L., McStay B., Baserga S.J. (2012). NOL11, implicated in the pathogenesis of North American Indian childhood cirrhosis, is required for pre-rRNA transcription and processing. PLoS Genet. 8: E1002892—E1002892. PMID 22916032 DOI:10.1371/journal.pgen.1002892

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25758 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TED0 (англ.) . Архів оригіналу за 14 червня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.