| LAMP1 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | LAMP1, CD107a, LAMPA, LGP120, lysosomal associated membrane protein 1 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 153330 MGI: 96745 HomoloGene: 4061 GeneCards: LAMP1 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • protein domain specific binding
• virus receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• enzyme binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• multivesicular body
• phagolysosome membrane
• везикула
• ендосома
• late endosome
• мембрана
• Синаптичні бульбашки
• cytolytic granule
• Меланосома
• integral component of plasma membrane
• alveolar lamellar body
• cell surface
• lysosomal membrane
• neuronal cell body
• вакуоля
• дендрит (нейробіологія)
• phagocytic vesicle
• perinuclear region of cytoplasm
• Сарколема
• лізосома
• endosome membrane
• екзосома
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• external side of plasma membrane
• гіалоплазма
• цитоплазма
• клітинна мембрана
• azurophil granule membrane
• autolysosome
• ficolin-1-rich granule membrane
• integral component of synaptic vesicle membrane
• late endosome membrane
|
|---|
| Біологічний процес | • protein stabilization
• Golgi to lysosome transport
• positive regulation of natural killer cell degranulation
• regulation of organelle transport along microtubule
• viral entry into host cell
• GO:0022415 viral process
• establishment of protein localization to organelle
• positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity
• granzyme-mediated apoptotic signaling pathway
• autophagic cell death
• neutrophil degranulation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 13: 113.3 – 113.32 Mb | Хр. 8: 13.21 – 13.23 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMP1 (англ. Lysosomal associated membrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 417 амінокислот, а молекулярна маса — 44 882[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MAAPGSARRP | | LLLLLLLLLL | | GLMHCASAAM | | FMVKNGNGTA | | CIMANFSAAF |
| SVNYDTKSGP | | KNMTFDLPSD | | ATVVLNRSSC | | GKENTSDPSL | | VIAFGRGHTL |
| TLNFTRNATR | | YSVQLMSFVY | | NLSDTHLFPN | | ASSKEIKTVE | | SITDIRADID |
| KKYRCVSGTQ | | VHMNNVTVTL | | HDATIQAYLS | | NSSFSRGETR | | CEQDRPSPTT |
| APPAPPSPSP | | SPVPKSPSVD | | KYNVSGTNGT | | CLLASMGLQL | | NLTYERKDNT |
| TVTRLLNINP | | NKTSASGSCG | | AHLVTLELHS | | EGTTVLLFQF | | GMNASSSRFF |
| LQGIQLNTIL | | PDARDPAFKA | | ANGSLRALQA | | TVGNSYKCNA | | EEHVRVTKAF |
| SVNIFKVWVQ | | AFKVEGGQFG | | SVEECLLDEN | | SMLIPIAVGG | | ALAGLVLIVL |
| IAYLVGRKRS | | HAGYQTI |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, лізосомі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Viitala J., Carlsson S.R., Siebert P.D., Fukuda M. (1988). Molecular cloning of cDNAs encoding lamp A, a human lysosomal membrane glycoprotein with apparent Mr approximately equal to 120,000. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 3743—3747. PMID 3131762 DOI:10.1073/pnas.85.11.3743
- Carlsson S.R., Lycksell P.-O., Fukuda M. (1993). Assignment of O-glycan attachment sites to the hinge-like regions of human lysosomal membrane glycoproteins lamp-1 and lamp-2. Arch. Biochem. Biophys. 304: 65—73. PMID 8323299 DOI:10.1006/abbi.1993.1322
- Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
- Johansson M., Lehto M., Tanhuanpaeae K., Cover T.L., Olkkonen V.M. (2005). The oxysterol-binding protein homologue ORP1L interacts with Rab7 and alters functional properties of late endocytic compartments. Mol. Biol. Cell. 16: 5480—5492. PMID 16176980 DOI:10.1091/mbc.E05-03-0189
- Fukuda M., Viitala J., Matteson J., Carlsson S.R. (1988). Cloning of cDNAs encoding human lysosomal membrane glycoproteins, h-lamp-1 and h-lamp-2. Comparison of their deduced amino acid sequences. J. Biol. Chem. 263: 18920—18928. PMID 3198605
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6499 (англ.) . Процитовано 27 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P11279 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 27 лютого 2017.
Див. також
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
Білки: кластери диференціації |
|---|
| | 1-50 | |
|---|
| | 51-100 | |
|---|
| | 101-150 | |
|---|
| | 151-200 | |
|---|
| | 201-250 | |
|---|
| | 251-300 | |
|---|
| | 301-350 | |
|---|
|
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
