SELP

SELP
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1FSB, 1G1Q, 1G1R, 1G1S, 1HES

Ідентифікатори
Символи SELP, CD62, CD62P, GMP140, GRMP, LECAM3, PADGEM, PSEL, selectin P
Зовнішні ІД OMIM: 173610 MGI: 98280 HomoloGene: 2260 GeneCards: SELP
Онтологія гена
Молекулярна функція

heparin binding
oligosaccharide binding
lipopolysaccharide binding
calcium-dependent protein binding
glycosphingolipid binding
fucose binding
carbohydrate binding
sialic acid binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
calcium ion binding
зв'язування з іоном металу

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
platelet alpha granule membrane
platelet dense granule membrane
external side of plasma membrane
міжклітинний простір
integral component of plasma membrane
клітинна мембрана

Біологічний процес

leukocyte cell-cell adhesion
heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
positive regulation of leukocyte migration
platelet degranulation
regulation of integrin activation
адгезія клітин
GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium
positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
inflammatory response
calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
positive regulation of platelet activation
leukocyte migration
response to lipopolysaccharide
calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
leukocyte tethering or rolling

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6403
20344
Ensembl
ENSG00000174175
ENSMUSG00000026580
UniProt
P16109
Q01102
RefSeq (мРНК)
NM_003005
NM_011347
RefSeq (білок)
NP_002996
NP_002996.2
NP_035477
Локус (UCSC) Хр. 1: 169.59 – 169.63 Mb Хр. 1: 163.94 – 163.98 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SELP (англ. Selectin P) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 830 амінокислот, а молекулярна маса — 90 834[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKA
YSWNISRKYCQNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKT
WTWVGTKKALTNEAENWADNEPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHC
LKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPGFYGPECEYVREC
GELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPSKLECLASGIW
TNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVG
PEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPSEGTMDCVHPLTAFAYGSSC
KFECQPGYRVRGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVHGSMDCS
PSLRAFQYDTNCSFRCAEGFMLRGADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQD
LPVPNEARVNCSHPFGAFRYQSVCSFTCNEGLLLVGASVLQCLATGNWNS
VPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQFICDEGYSLSGPE
RLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTCHF
SCDNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGLQCPALTTPGQ
GTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACR
AVKCSELHVNKPIAMNCSNLWGNFSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQE
NGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLLALLRKRFR
QKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAFDPSP

Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

  • Johnston G.I., Cook R.G., McEver R.P. (1989). Cloning of GMP-140, a granule membrane protein of platelets and endothelium: sequence similarity to proteins involved in cell adhesion and inflammation. Cell. 56: 1033—1044. PMID 2466574 DOI:10.1016/0092-8674(89)90636-3
  • Pouyani T., Seed B. (1995). PSGL-1 recognition of P-selectin is controlled by a tyrosine sulfation consensus at the PSGL-1 amino terminus. Cell. 83: 333—343. PMID 7585950 DOI:10.1016/0092-8674(95)90174-4
  • Wilkins P.P., Moore K.L., McEver R.P., Cummings R.D. (1995). Tyrosine sulfation of P-selectin glycoprotein ligand-1 is required for high affinity binding to P-selectin. J. Biol. Chem. 270: 22677—22680. PMID 7559387 DOI:10.1074/jbc.270.39.22677
  • Florian V., Schlueter T., Bohnensack R. (2001). A new member of the sorting nexin family interacts with the C-terminus of P-selectin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 281: 1045—1050. PMID 11237770 DOI:10.1006/bbrc.2001.4467
  • Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
  • Kerr S.C., Fieger C.B., Snapp K.R., Rosen S.D. (2008). Endoglycan, a member of the CD34 family of sialomucins, is a ligand for the vascular selectins. J. Immunol. 181: 1480—1490. PMID 18606703 DOI:10.4049/jimmunol.181.2.1480

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10721 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  4. UniProt, P16109 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350