MYF6

MYF6
Ідентифікатори
Символи MYF6, CNM3, MRF4, bHLHc4, myf-6, Myf6, myogenic factor 6
Зовнішні ІД OMIM: 159991 MGI: 97253 HomoloGene: 1850 GeneCards: MYF6
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
protein dimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
E-box binding
protein heterodimerization activity
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

нуклеоплазма
RNA polymerase II transcription regulator complex
клітинне ядро

Біологічний процес

somitogenesis
диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of muscle cell differentiation
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
muscle cell fate commitment
muscle organ development
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of skeletal muscle fiber development
multicellular organism development
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of myoblast fusion
skeletal muscle tissue regeneration
positive regulation of myoblast differentiation
muscle tissue morphogenesis
skeletal muscle cell differentiation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
skeletal muscle tissue development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4618
17878
Ensembl
ENSG00000111046
ENSMUSG00000035923
UniProt
P23409
P15375
RefSeq (мРНК)
NM_002469
NM_008657
RefSeq (білок)
NP_002460
NP_032683
Локус (UCSC) Хр. 12: 80.71 – 80.71 Mb Хр. 10: 107.33 – 107.33 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MYF6 (англ. Myogenic factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 242 амінокислот, а молекулярна маса — 26 953[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMMDLFETGSYFFYLDGENVTLQPLEVAEGSPLYPGSDGTLSPCQDQMPP
EAGSDSSGEEHVLAPPGLQPPHCPGQCLIWACKTCKRKSAPTDRRKAATL
RERRRLKKINEAFEALKRRTVANPNQRLPKVEILRSAISYIERLQDLLHR
LDQQEKMQELGVDPFSYRPKQENLEGADFLRTCSSQWPSVSDHSRGLVIT
AKEGGASIDSSASSSLRCLSSIVDSISSEERKLPCVEEVVEK

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, міогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Braun T., Bober E., Winter B., Rosenthal N., Arnold H.H. (1990). Myf-6, a new member of the human gene family of myogenic determination factors: evidence for a gene cluster on chromosome 12. EMBO J. 9: 821—831. PMID 2311584
  • Kerst B., Perrot A., Osterziel K.-J., Huebner C., Speer A. (1998). MYF6 mutations resulting in A112S and A90D substitutions in patients with skeletal or cardiac muscle pathology. Hum. Mutat. 12: 220—220.

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7566 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, P23409 (англ.) . Архів оригіналу за 25 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші