ZNF451

ZNF451
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

5D2M

Ідентифікатори
Символи ZNF451, COASTER, dJ417I1.1, zinc finger protein 451, ZATT
Зовнішні ІД OMIM: 615708 MGI: 2137896 HomoloGene: 9188 GeneCards: ZNF451
Онтологія гена
Молекулярна функція

SUMO ligase activity
GO:0001106 transcription corepressor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
transferase activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

PML body
клітинне ядро
нуклеоплазма
histone methyltransferase complex

Біологічний процес

negative regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter
negative regulation of histone H3-K9 acetylation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
protein sumoylation
transcription, DNA-templated
регуляція експресії генів

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
26036
98403
Ensembl
ENSG00000112200
ENSMUSG00000042197
UniProt
Q9Y4E5
Q8C0P7
RefSeq (мРНК)
NM_001031623
NM_001257273
NM_015555
NM_001290699
NM_001290700
NM_133817
NM_001359274
NM_001359275
RefSeq (білок)
NP_001026794
NP_001244202
NP_056370
NP_001277628
NP_001277629
NP_598578
NP_001346203
NP_001346204
Локус (UCSC) Хр. 6: 57.09 – 57.17 Mb Хр. 1: 33.8 – 33.85 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZNF451 (англ. Zinc finger protein 451) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 061 амінокислот, а молекулярна маса — 121 484[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGDPGSEIIESVPPAGPEASESTTDENEDDIQFVSEGPLRPVLEYIDLVS
SDDEEPSTSYTDENIKRKDHIDYQKDKVALTLARLARHVEVEKQQKEEKN
RAFREKIDFQHAHGLQELEFIRGHSDTEAARLCVDQWLKMPGLKTGTINC
GTKSSFRRGGHTWVSGKPILCPIMHCNKEFDNGHLLLGHLKRFDHSPCDP
TITLHGPFFSSFACVVCYKKFVTQQQYRDHLFDKEATDDGHNNNLLPQII
QCFACPNCFLLFSRKEECSKHMSGKNHFHQSFKLGDNKGIAHPISFPSFA
KKLLISLCKDVPFQVKCVACHKTLRSHMELTAHFRVHCRNAGPVAVAEKS
ITQVAEKFILRGYCPDCNQVFVDETSTQNHKQNSGHKVRVINSVEESVLL
YCHSSEGNKDPSSDLHLLLDQSKFSSLKRTMSIKESSSLECIAIPKKKMN
LKDKSHEGVACVQKEKSVVKTWFCECNQRFPSEDAVEKHVFSANTMGYKC
VVCGKVCDDSGVIRLHMSRIHGGAHLNNFLFWCRTCKKELTRKDTIMAHV
TEFHNGHRYFYEMDEVEGETLPSSSTTLDNLTANKPSSAITVIDHSPANS
SPRGKWQCRICEDMFDSQEYVKQHCMSLASHKFHRYSCAHCRKPFHKIET
LYRHCQDEHDNEIKIKYFCGLCDLIFNVEEAFLSHYEEHHSIDYVFVSEK
TETSIKTEDDFPVIETSNQLTCGCRESYICKVNRKEDYSRCLQIMLDKGK
LWFRCSLCSATAQNLTDMNTHIHQVHKEKSDEEEQQYVIKCGTCTKAFHD
PESAQQHFHRKHCFLQKPSVAHFGSEKSNLYKFTASASHTERKLKQAINY
SKSLDMEKGVENDLSYQNIEEEIVELPDLDYLRTMTHIVFVDFDNWSNFF
GHLPGHLNQGTFIWGFQGGNTNWKPPLNCKIYNYLNRIGCFFLHPRCSKR
KDAADFAICMHAGRLDEQLPKQIPFTILSGDQGFLELENQFKKTQRPAHI
LNPHHLEGDMMCALLNSISDTTKECDSDDNMGAKNTSIGEEFISTEDVEL
EEAIRRSLEEM

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Karvonen U., Jaeaeskelaeinen T., Rytinki M., Kaikkonen S., Palvimo J.J. (2008). ZNF451 is a novel PML body- and SUMO-associated transcriptional coregulator. J. Mol. Biol. 382: 585—600. PMID 18656483 DOI:10.1016/j.jmb.2008.07.016
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
  • Cappadocia L., Pichler A., Lima C.D. (2015). Structural basis for catalytic activation by the human ZNF451 SUMO E3 ligase. Nat. Struct. Mol. Biol. 22: 968—975. PMID 26524494 DOI:10.1038/nsmb.3116

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21091 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9Y4E5 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші