KCNJ6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2E4F, 3AGW, 3AT8, 3AT9, 3ATA, 3ATB, 3ATD, 3ATE, 3ATF, 3AUW, 3SYA, 3SYC, 3SYO, 3SYP, 3SYQ, 3VSQ, 4KFM

Ідентифікатори

Символи

KCNJ6, BIR1, GIRK-2, GIRK2, KATP-2, KATP2, KCNJ7, KIR3.2, hiGIRK2, KPLBS, potassium voltage-gated channel subfamily J member 6, potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 6

Зовнішні ІД

OMIM: 600877 MGI: 104781 HomoloGene: 1688 GeneCards: KCNJ6

Пов'язані генетичні захворювання

alcohol abuse, Keppen–Lubinsky syndrome^[1]

Реагує на сполуку

sodium ion, SCH-23390^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• G-protein activated inward rectifier potassium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • inward rectifier potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • мембрана
Біологічний процес	• potassium ion transport • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • GO:0015915 транспорт • potassium ion import across plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3763


16522

Ensembl


ENSG00000157542


ENSMUSG00000043301

UniProt


P48051


P48542

RefSeq (мРНК)


NM_002240


NM_001025584 NM_001025585 NM_001025590 NM_010606

RefSeq (білок)


NP_002231


NP_001020755 NP_001020756 NP_001020761 NP_034736

Локус (UCSC)

Хр. 21: 37.61 – 38.12 Mb

Хр. 16: 94.55 – 94.8 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNJ6 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily J member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 423 амінокислот, а молекулярна маса — 48 451^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKLTESMTN	VLEGDSMDQD	VESPVAIHQP	KLPKQARDDL	PRHISRDRTK
RKIQRYVRKD	GKCNVHHGNV	RETYRYLTDI	FTTLVDLKWR	FNLLIFVMVY
TVTWLFFGMI	WWLIAYIRGD	MDHIEDPSWT	PCVTNLNGFV	SAFLFSIETE
TTIGYGYRVI	TDKCPEGIIL	LLIQSVLGSI	VNAFMVGCMF	VKISQPKKRA
ETLVFSTHAV	ISMRDGKLCL	MFRVGDLRNS	HIVEASIRAK	LIKSKQTSEG
EFIPLNQTDI	NVGYYTGDDR	LFLVSPLIIS	HEINQQSPFW	EISKAQLPKE
ELEIVVILEG	MVEATGMTCQ	ARSSYITSEI	LWGYRFTPVL	TLEDGFYEVD
YNSFHETYET	STPSLSAKEL	AELASRAELP	LSWSVSSKLN	QHAELETEEE
EKNLEEQTER	NGDVANLENE	SKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCNJ6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6267 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, P48051 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані