VDAC1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JK4, 2K4T

Ідентифікатори

Символи

VDAC1, PORIN, VDAC-1, voltage dependent anion channel 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604492 MGI: 106919 HomoloGene: 107244 GeneCards: VDAC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• porin activity • transmembrane transporter binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • anion channel activity • voltage-gated anion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • Синаптичні бульбашки • myelin sheath • клітинна мембрана • мітохондріальна зовнішня мембрана • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • membrane raft • mitochondrial nucleoid • екзосома • pore complex • клітинне ядро • mitochondrial permeability transition pore complex • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• chemical synaptic transmission • epithelial cell differentiation • mitochondrial calcium ion transmembrane transport • neuron-neuron synaptic transmission • ion transport • навчення • anion transport • behavioral fear response • anion transmembrane transport • regulation of autophagy of mitochondrion • трансмембранний транспорт • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • GO:0022415 viral process • macroautophagy • GO:0097285 апоптоз • regulation of anion transmembrane transport • GO:0015915 транспорт • pyruvate metabolic process • inorganic anion transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7416


22333

Ensembl


ENSG00000213585


ENSMUSG00000020402

UniProt


P21796


Q60932

RefSeq (мРНК)


NM_003374


NM_011694 NM_001362693

RefSeq (білок)


NP_003365

NP_035824 NP_001349622 NP_001387915 NP_001387916 NP_001387917
NP_001387918

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 11: 52.36 – 52.39 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VDAC1 (англ. Voltage dependent anion channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 283 амінокислот, а молекулярна маса — 30 773^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVPPTYADL	GKSARDVFTK	GYGFGLIKLD	LKTKSENGLE	FTSSGSANTE
TTKVTGSLET	KYRWTEYGLT	FTEKWNTDNT	LGTEITVEDQ	LARGLKLTFD
SSFSPNTGKK	NAKIKTGYKR	EHINLGCDMD	FDIAGPSIRG	ALVLGYEGWL
AGYQMNFETA	KSRVTQSNFA	VGYKTDEFQL	HTNVNDGTEF	GGSIYQKVNK
KLETAVNLAW	TAGNSNTRFG	IAAKYQIDPD	ACFSAKVNNS	SLIGLGYTQT
LKPGIKLTLS	ALLDGKNVNA	GGHKLGLGLE	FQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до поринів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

Decker W.K., Bowles K.R., Schatte E.C., Towbin J.A., Craigen W.J. (1999). Revised fine mapping of the human voltage-dependent anion channel loci by radiation hybrid analysis. Mamm. Genome. 10: 1041—1042. PMID 10501981 DOI:10.1007/s003359901158
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Thomas L., Blachly-Dyson E., Colombini M., Forte M.A. (1993). Mapping of residues forming the voltage sensor of the voltage-dependent anion-selective channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5446—5449. PMID 7685903 DOI:10.1073/pnas.90.12.5446
Yu W.H., Wolfgang W., Forte M.A. (1995). Subcellular localization of human voltage-dependent anion channel isoforms. J. Biol. Chem. 270: 13998—14006. PMID 7539795 DOI:10.1074/jbc.270.23.13998
Verrier F., Mignotte B., Jan G., Brenner C. (2003). Study of PTPC composition during apoptosis for identification of viral protein target. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1010: 126—142. PMID 15033708 DOI:10.1196/annals.1299.022
Zamarin D., Garcia-Sastre A., Xiao X., Wang R., Palese P. (2005). Influenza virus PB1-F2 protein induces cell death through mitochondrial ANT3 and VDAC1. PLoS Pathog. 1: 40—54. PMID 16201016 DOI:10.1371/journal.ppat.0010004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12669 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P21796 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані