TPCN2

Ідентифікатори

Символи

TPCN2, SHEP10, TPC2, two pore segment channel 2

Зовнішні ІД

OMIM: 612163 MGI: 2385297 HomoloGene: 16375 GeneCards: TPCN2

Реагує на сполуку

phosphatidyl (3,5) inositol biphosphate, верапаміл^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein kinase binding • NAADP-sensitive calcium-release channel activity • voltage-gated calcium channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • endosome membrane • лізосома • lysosomal membrane
Біологічний процес	• release of sequestered calcium ion into cytosol • membrane depolarization during action potential • response to vitamin D • regulation of ion transmembrane transport • cellular calcium ion homeostasis • ion transport • ion transmembrane transport • regulation of autophagy • calcium ion transmembrane transport • lysosome organization • calcium-mediated signaling • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • smooth muscle contraction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


219931


233979

Ensembl


ENSG00000162341


ENSMUSG00000048677

UniProt


Q8NHX9


Q8BWC0

RefSeq (мРНК)


NM_139075


NM_146206

RefSeq (білок)


NP_620714


NP_666318

Локус (UCSC)

Хр. 11: 69.05 – 69.14 Mb

Хр. 7: 144.74 – 144.84 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TPCN2 (англ. Two pore segment channel 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 752 амінокислот, а молекулярна маса — 85 243^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEPQAESEP	LLGGARGGGG	DWPAGLTTYR	SIQVGPGAAA	RWDLCIDQAV
VFIEDAIQYR	SINHRVDASS	MWLYRRYYSN	VCQRTLSFTI	FLILFLAFIE
TPSSLTSTAD	VRYRAAPWEP	PCGLTESVEV	LCLLVFAADL	SVKGYLFGWA
HFQKNLWLLG	YLVVLVVSLV	DWTVSLSLVC	HEPLRIRRLL	RPFFLLQNSS
MMKKTLKCIR	WSLPEMASVG	LLLAIHLCLF	TMFGMLLFAG	GKQDDGQDRE
RLTYFQNLPE	SLTSLLVLLT	TANNPDVMIP	AYSKNRAYAI	FFIVFTVIGS
LFLMNLLTAI	IYSQFRGYLM	KSLQTSLFRR	RLGTRAAFEV	LSSMVGEGGA
FPQAVGVKPQ	NLLQVLQKVQ	LDSSHKQAMM	EKVRSYGSVL	LSAEEFQKLF
NELDRSVVKE	HPPRPEYQSP	FLQSAQFLFG	HYYFDYLGNL	IALANLVSIC
VFLVLDADVL	PAERDDFILG	ILNCVFIVYY	LLEMLLKVFA	LGLRGYLSYP
SNVFDGLLTV	VLLVLEISTL	AVYRLPHPGW	RPEMVGLLSL	WDMTRMLNML
IVFRFLRIIP	SMKLMAVVAS	TVLGLVQNMR	AFGGILVVVY	YVFAIIGINL
FRGVIVALPG	NSSLAPANGS	APCGSFEQLE	YWANNFDDFA	AALVTLWNLM
VVNNWQVFLD	AYRRYSGPWS	KIYFVLWWLV	SSVIWVNLFL	ALILENFLHK
WDPRSHLQPL	AGTPEATYQM	TVELLFRDIL	EEPGEDELTE	RLSQHPHLWL
CR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lam A.K., Galione A., Lai F.A., Zissimopoulos S. (2013). Hax-1 identified as a two-pore channel (TPC)-binding protein. FEBS Lett. 587: 3782—3786. PMID 24188827 DOI:10.1016/j.febslet.2013.10.031

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Two pore segment channel 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20820 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8NHX9 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані